U primární tuberkulózy je léze obvykle lokalizována v lymfatických uzlinách, plicích, pohrudnici a někdy i v jiných orgánech: ledvinách, kloubech, kostech, pobřišnici. Oblast specifického zánětu může být velmi malá a při vyšetření zůstat skrytá. Pokud je léze rozsáhlá, je obvykle detekována při klinickém a radiologickém vyšetření pacienta.