Je třeba poznamenat, že pokud má pacient onemocnění, které představuje přímé ohrožení života, je endoskopie naprosto oprávněná. Gastroduodenoskopie by tedy měla být provedena i u pacienta s infarktem myokardu nebo akutní cévní mozkovou příhodou při gastrointestinálním krvácení, a to jak za účelem zjištění příčiny a rozsahu krvácení, tak i za účelem jeho zastavení.
