Analýza EEG se provádí během záznamu a nakonec po jeho dokončení. Během záznamu se posuzuje přítomnost artefaktů (indukce síťových proudových polí, mechanické artefakty pohybu elektrod, elektromyogram, elektrokardiogram atd.) a přijímají se opatření k jejich odstranění. Posuzuje se frekvence a amplituda EEG, identifikují se charakteristické grafické prvky a určuje se jejich prostorové a časové rozložení.