V některých případech, častěji u žen, začíná akutní pyelonefritida akutní cystitidou (časté a bolestivé močení, bolest močového měchýře, terminální hematurie). Další příznaky akutní myelonefritidy: celková únava, slabost, svalové a bolesti hlavy, ztráta chuti k jídlu, nevolnost, zvracení.